本校103學年度經核准增設及調整系所如下：
（一） 新增分組：資訊工程學系學士班學籍分組為「資工組」及「國際組」。
（二） 整併並分組：
１、「資訊工程學系碩士班」及「網路與多媒體科技碩士班」整併為「資訊工程學系碩士班」，並學籍分組為「資工組」及「國際組」。
２、原「海洋生物多樣性及演化研究所」及「海洋生物科技研究所」整併為「海洋生物研究所」，並新增「生物多樣性及演化組」及「生物科技組」。
（三）更名並新增班次：原「民族發展與社會工作學系」更名為「民族事務與發展學系」，設學士班及碩士班，並新增「民族社會工作碩士在職專班」。
（四）新增學位學程：
１、民族社會工作學位學程(學士班)。
２、人文與環境碩士學位學程(碩士班)。
（五）分組整併：原公共行政學系碩士班原學籍分組為「大陸與兩岸事務組」、「國家行政與公共政策組」取消分組。